Santiago Montes is een 8-jarige jongen die het geheimzinnige kompas van de legendarische piraat Capitan Calavera ontdekt heeft. Daardoor is hij de volgende piratenbeschermer van de zee geworden. In Kaapverdië, het land waar Santiago en zijn vrienden vertoeven, wordt een vijandig piratenschip ontdekt. Samen met zijn bemanning, neef Thomas en Lorelai de zeemeermin, bereiden ze zich voor om de strijd met de schurken aan te gaan.